安全保護裝置為了人員、設備、產品的安全，凍干機應設置嚴密可靠的安全保護裝置。
系統安全保護
①超壓保護。凍干箱、冷阱等是壓力容器。蒸氣滅菌時，壓力超過設定值時報警，自動關閉進蒸氣閥：壓力超過安全閥調定值時，報警并打開安全閥泄壓。
②門上裝設限制開關，在門開啟時液壓壓塞系統不能啟動。
③門不完全鎖閉保護。門未完全鎖閉時，進蒸氣閥打不開，
安全閥處于開啟狀態。只有門鎖閉到位時，進蒸氣閥才能打開，安全閥亦處于關閉狀態，
④凍干箱內壓力高于大氣壓，箱門鎖閉裝置不能開鎖，只有箱內壓力全部釋放，鎖才能打開。
⑤所有與操作人員接近的供電都是低壓電，所有機器外緣的運動件都配有防護罩。
