冷藏運輸制冷裝置與陸地冷庫裝置的工作原理、結構基本上是相同的，但冷藏運輸船的特殊要求有以下4點：
1)冷藏運輸船貨艙必須具有良好的隔熱與防潮設施。船舶結構特殊，有金屬骨架突入隔熱層中而造成熱流短路(冷橋)，將對冷藏產生極為不利的影響。故在同樣的隔熱層裝置中，冷藏運輸船貨艙外圍護結構的單位面積滲入熱比陸地冷庫大得多，在突入隔熱層中的金屬骨架外面(即靠冷藏貨艙一側)，至少需要相當于50mm厚的聚氨酯發泡隔熱層，以防止外表面凝水和減少冷量過分損耗。此外，冷藏運輸船貨艙在使用時，有時會出現冷藏貨艙氣壓高于隔熱層內部氣壓的現象，這樣冷藏貨艙中的水蒸氣會從隔熱層表面滲入隔熱層內部，因此冷藏運輸艙的外圍護結構必須有良好的防潮和隔氣設施。
2)冷藏運輸船的制冷壓縮機及輔助設備在重量、體積、安全可靠性及備件方面，均比陸地的制冷設備有更高的要求。這是因為冷藏運輸船在航行中只能作簡單的維修，一旦制冷裝置發生故障而又難以排除時，有可能造成巨大的損失。
3)冷藏運輸船的制冷壓縮機及輔助設備還要求船舶在縱傾10°，橫傾15°、振動以及在高溫、高濕條件下，均能夠正常工作，凡與鹽霧接觸的部件，要求耐腐蝕或采取防腐措施。
4)冷藏船的制冷裝置，必須設置備用的制冷壓縮機(包括發動機)和其他輔助設備，以保證制冷裝置能夠在任何一臺制冷壓縮機或設備損壞的情況下，仍能維持正常的冷藏溫度。
