在中央空調系統不供冷或不供暖的情況下，不論是其冷卻水系統還是用戶側水系統，也不論是清洗單臺設備還是清洗全系統，在一個閉合回路中，化學清洗一般按下列程序進行：
水沖洗→殺菌滅藻清洗→堿洗→水沖洗→酸洗→水沖洗→中和純化（或預膜）
（1）水沖洗
水沖洗的目的是盡可能沖洗掉回路中的灰塵、泥沙、脫落的藻類以及腐蝕產物等一些疏松的污垢。沖洗時水的流速以大于0.15m/s為宜，必要時可作正反向切換沖洗。沖洗合格后，排盡回路中的沖洗水。
（2）殺菌滅藻清洗
殺菌滅藻清洗的目的是殺滅回路中的微生物，并使設備和管道表面附著的生物粘泥剝離脫落。在排盡沖洗水后重新將回路注滿水，并加入適當的殺生劑，然后開泵循環清洗。在清洗過程中，必須定時測定水的濁度變化，以掌握清洗效果。一般濁度是隨著清洗時間的延長逐漸升高的，到最大值后，回路中的濁度即趨于不變，此時就可以結束清洗，排除清洗水。
（3）堿洗
堿洗的主要目的是去除回路中的油污，以保證酸洗均勻（一般是在回路中有油污時才需要進行堿洗）。在重新注滿水的回路中加入適量的堿洗劑，并開泵循環清洗，當回路中的堿度和油含量基本趨于不變時即可結束堿洗，排盡堿洗水。
（4）堿洗后的水沖洗
堿洗后的水沖洗是為了去除回路中殘留的堿洗液，并將部分雜質帶出回路。在沖洗過程中要經常測試排出的沖洗水的PH值和濁度，當排出水呈中性或微堿性，且濁度降低到一定標準時，水沖洗即可結束。
（5）酸洗
酸洗的目的是去除水垢和腐蝕產物。在回路充滿水后，將酸洗劑加入回路中，然后開泵循環清洗。在可能的情況下，應切換清洗液的循環流動方向。
清洗過程中，定期（一般每半小時一次）測試酸洗液中酸的濃度、金屬離子（F2+、 Fe3+、Cu+）的濃度、PH值等，當金屬離子濃度趨于不變時即為酸洗終點，排盡酸洗液。
（6）酸洗后的水沖洗
此次水沖洗是為了去除回路中殘留的酸洗液和脫落的固體顆粒。方法是用大量的水對回路進行開路沖洗，在沖洗過程中，每隔十分鐘測試一次排出的沖洗液的PH值，當接近中性時停止沖洗。
（7）中和鈍化（或預膜）
金屬設備或管道經過酸洗后，其金屬表面處于十分活潑的活性狀態，很容易重新與氧結合而被氧化生銹。因此，設備或管道在清洗后暫時不使用時，就需要進行鈍化處理，然后加以封存。
鈍化即金屬經陽極氧化或化學方法（如強氧化劑反應）處理后，由活潑態轉變為不活潑態（鈍態）的過程。鈍化后的金屬由于表面形成緊密的氧化物保護薄膜，因而不易腐蝕。常用的鈍化劑有磷酸氫二鈉（Na?HPO?）和磷酸二氫鈉（NaH?PO?），在90℃下鈍化1h即可。此外，鈍化劑的配方還有以下幾種：
①H?PO?-1%，ZnSO?一1%，Na?SiO?-2%，NaNO?-0.4%；
②H?PO?一0.5%，ZnSO?一0.5%，Na?SiO?—0.5%，NaN0?-0.4%；
③尿素一20%，亞硝酸鈉一20%，苯甲酸鈉一4%。
如果設備或管道清洗后馬上就投入使用，則酸洗后可直接預膜而不需要進行鈍化。
