凍結間與冷藏間自控回路不同，它除了降溫和應維持恒定的庫房溫度外，還要保證食品所必需的冷加工時間，融霜及輸送機構的自動控制。另外，凍結間或凍結裝置的種類很多，工藝流程也各不相同，現以吊軌型凍結間為例敘述凍結間的自動控制。
按照凍結間的工藝流程，一般可分為五個階段：空庫降溫(或空庫保溫）、進貨、凍結、出貨和融霜。
1.凍結間溫度的要求
①空庫保溫：對某一時期內停止使用的凍結間須處于一定的負溫。一般保持在-5℃以下，以防止構筑物因凍融循環而引起的破壞，空庫保溫一般由設在機房的遙測溫度計顯示室溫，使用按鈕操作使系統投入或停止運行，同時也受溫度調節器的控制。
②空庫降溫：進貨前，先將凍結間內溫度降低到一定的負值，一般采用-10~-15℃。它有兩個作用，一個是防止熱貨進入后使構筑物表面溫度升高至0℃以上，產生凍融循環；另一個是使熱貨盡快降溫。空庫降溫一般由裝在凍結間內的溫度調節器控制，在空庫或進貨情況下，當庫溫回升至上限值時，溫度調節器動作。使供液和回汽電磁主閥開啟，系統投入運行。
③凍結時間：當進貨完畢，系統自動進入凍結過程，時間繼電器動作，凍結制冷系統按調定的凍結時間開始工作，在凍結過程中如因停電、停機等時間均不計在內，當累計凍結時間達到預定值(一般一次凍結的累計時間定為20h，可根據貨物實際的凍結時間進行調整)，又庫溫降至下限值，機房控制屏出現“凍結完成”信號，供液電磁主閥關閉，風機停止運轉，延時幾分鐘，回汽電磁主閥關閉，制冷系統停止運行。所以，制冷系統投入運行是受庫房溫度的控制，而制冷系統停止運行則受庫溫和凍結時間兩者的控制，這樣可避免在凍結過程中出現庫溫已降至下限值，而食品還未凍透，制冷系統已停止運行的現象。
2.凍結間自控設計中采用的幾和回路
在蒸發溫度較低的凍結自控回路中，選用合適的主閥，以降低管道壓力損失，顯得更重要，如ZCL-00QB氣體常閉型電磁主閥，全開時壓力損失為14kPa，而這14kPa的壓力損失所對應的溫度差值在低蒸發溫度下要比高蒸發溫度時大得多。例如對氨，當蒸發溫度t.=-40℃時，14kPa的壓力損失對應的溫度差值為4℃左右；而當t=-10℃時，對應的溫度差值只有1℃，為了降低壓力損失，在凍結間回汽管道上選用壓力損失很微小的ZCLT-00QB氣體常閉型雙電磁主閥或ZCL-00QK氣體常開型電磁主閥。
融霜采用熱氨和水相結合的方法：熱氨管道上裝有ZCHD-00QB氣體常閉型電磁恒壓主閥，以控制出口端壓力不超過0.6MPa，排液管道上裝有ZCL-00YB液體常閉型電磁主閥。為了防止融霜時供液電磁主閥背壓開啟，因此在ZCL-00YB供液電磁主閥后應設置ZZRN-00Y止逆閥。供水管上裝有ZCS-00W型水電磁閥，閥后接有放水管，以防閥后水管凍裂，放水管還裝有水流繼電器，以檢驗水泵或電磁水閥是否開啟及上水管是否有水。
為了簡化融霜自控系統，凍結間融霜當水溫高于+20℃時，可采用水單獨自動融霜，為了排除蒸發器內油及外面霜層，每星期用熱氨手動融霜1~2次。由于供液和回汽主閥是關閉的，為了防止水融霜時蒸發器內壓力超過預定值，則可在排液管道上或回汽管道上裝設PF32型自動旁通閥，當壓力超過預定值時，液體或汽體通過自動旁通閥排至低壓循環貯液桶內以降壓。
凍結間自控回路形式與圖中類似，不同點在于回汽管道上一般不采用常閉型電磁主閥，而改用雙電磁主閥或常開型電磁主閥，以免在回汽管上引起過大的溫度降。
為了使自控系統更簡單，國內小型冷庫更多采用供液自控，回汽不自控的方案。
另外，在小型冷庫中，為了簡化系統，一般將凍結間與凍藏間合為一個蒸發溫度回路。這樣，當凍結間大量進貨時，蒸發壓力將會升高，回汽壓力相應升高。凍結間的回汽可能倒竄至凍藏間蒸發器中，影響凍藏間溫度的穩定性，即可能因反壓差使凍藏間回汽主閥強行開啟。若凍藏間回汽不用自動閥門，更會使凍結間“倒竄”來的回汽長驅直入。克服這個弊病較常用的方法是在凍藏間回汽管上裝設ZZRN-00Q氣用止回閥，當閥后壓力大于閥前壓力約8kPa時，止回閥自動關閉，待閥后壓力降至低于閥前壓力8kPa時，止回閥又開啟，如圖所示。
